MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces bingchenggensis BCW-1 chromosome

Total Repeats: 298033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016582	TCG	2	6	734	739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982758
2	NC_016582	GAT	2	6	741	746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374982758
3	NC_016582	CAC	2	6	747	752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374982758
4	NC_016582	CG	3	6	793	798	0 %	0 %	50 %	50 %	374982758
5	NC_016582	CGG	3	9	1316	1324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982759
6	NC_016582	ATC	2	6	1338	1343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374982759
7	NC_016582	GGC	2	6	1351	1356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982759
8	NC_016582	GC	3	6	1355	1360	0 %	0 %	50 %	50 %	374982759
9	NC_016582	GCGG	2	8	1457	1464	0 %	0 %	75 %	25 %	374982759
10	NC_016582	CAGG	2	8	1473	1480	25 %	0 %	50 %	25 %	374982759
11	NC_016582	CCGG	2	8	1490	1497	0 %	0 %	50 %	50 %	374982759
12	NC_016582	CCT	2	6	1516	1521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374982759
13	NC_016582	TCA	2	6	1534	1539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374982759
14	NC_016582	AGG	2	6	1562	1567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374982759
15	NC_016582	GCC	2	6	1627	1632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982759
16	NC_016582	AACC	2	8	1655	1662	50 %	0 %	0 %	50 %	374982759
17	NC_016582	GTG	2	6	1721	1726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374982760
18	NC_016582	CGA	2	6	1803	1808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982760
19	NC_016582	GTC	3	9	1819	1827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982760
20	NC_016582	CGT	2	6	1828	1833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982760
21	NC_016582	GCG	2	6	1907	1912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982760
22	NC_016582	ACG	2	6	1921	1926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982760
23	NC_016582	GCC	2	6	1964	1969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982760
24	NC_016582	GC	3	6	2118	2123	0 %	0 %	50 %	50 %	374982760
25	NC_016582	CGG	2	6	2127	2132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982760
26	NC_016582	GGGCGA	2	12	2166	2177	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	374982760
27	NC_016582	C	18	18	2184	2201	0 %	0 %	0 %	100 %	374982760
28	NC_016582	AGC	2	6	2213	2218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982760
29	NC_016582	CTC	2	6	2227	2232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374982760
30	NC_016582	CTGGAA	2	12	2251	2262	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374982760
31	NC_016582	TCG	2	6	2360	2365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982760
32	NC_016582	GTG	2	6	2366	2371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374982760
33	NC_016582	TGC	2	6	2372	2377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982760
34	NC_016582	ACG	3	9	2378	2386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982760
35	NC_016582	CCT	2	6	2439	2444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374982760
36	NC_016582	GTCG	2	8	2478	2485	0 %	25 %	50 %	25 %	374982760
37	NC_016582	CAG	2	6	2497	2502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982760
38	NC_016582	CG	3	6	2819	2824	0 %	0 %	50 %	50 %	374982761
39	NC_016582	GCC	2	6	2876	2881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982761
40	NC_016582	CGG	2	6	2895	2900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982761
41	NC_016582	GGA	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374982761
42	NC_016582	CGG	2	6	3061	3066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982762
43	NC_016582	AGC	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982762
44	NC_016582	GCC	2	6	3183	3188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982762
45	NC_016582	ACC	2	6	3189	3194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374982762
46	NC_016582	CGG	2	6	3294	3299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982762
47	NC_016582	GCC	2	6	3339	3344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982762
48	NC_016582	ATC	2	6	3350	3355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374982762
49	NC_016582	CTG	2	6	3356	3361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
50	NC_016582	CCG	2	6	3376	3381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982762
51	NC_016582	CAG	2	6	3398	3403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982762
52	NC_016582	TGC	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
53	NC_016582	TGG	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374982762
54	NC_016582	CGA	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982762
55	NC_016582	TCG	2	6	3492	3497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
56	NC_016582	GCG	2	6	3516	3521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982762
57	NC_016582	GAGC	2	8	3541	3548	25 %	0 %	50 %	25 %	374982762
58	NC_016582	CGG	2	6	3656	3661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982762
59	NC_016582	GCG	2	6	3684	3689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982762
60	NC_016582	GCT	2	6	3746	3751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
61	NC_016582	CTT	2	6	3763	3768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374982762
62	NC_016582	GCG	2	6	3801	3806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982762
63	NC_016582	GC	3	6	3843	3848	0 %	0 %	50 %	50 %	374982762
64	NC_016582	GTC	2	6	3917	3922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
65	NC_016582	CAGG	2	8	3965	3972	25 %	0 %	50 %	25 %	374982762
66	NC_016582	CAG	2	6	3974	3979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982762
67	NC_016582	GTC	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
68	NC_016582	GTC	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
69	NC_016582	GAA	2	6	4012	4017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374982762
70	NC_016582	GCCG	2	8	4030	4037	0 %	0 %	50 %	50 %	374982762
71	NC_016582	CGGG	2	8	4074	4081	0 %	0 %	75 %	25 %	374982762
72	NC_016582	TGC	2	6	4082	4087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
73	NC_016582	CGT	2	6	4105	4110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
74	NC_016582	CTC	2	6	4139	4144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374982762
75	NC_016582	GCT	2	6	4175	4180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
76	NC_016582	GCG	2	6	4185	4190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982762
77	NC_016582	GGA	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374982762
78	NC_016582	GC	3	6	4216	4221	0 %	0 %	50 %	50 %	374982762
79	NC_016582	TGA	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374982762
80	NC_016582	AGC	2	6	4302	4307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982762
81	NC_016582	CTT	2	6	4309	4314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374982762
82	NC_016582	CAG	2	6	4343	4348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982762
83	NC_016582	TCA	2	6	4381	4386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374982762
84	NC_016582	CAC	2	6	4400	4405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374982762
85	NC_016582	GCC	2	6	4422	4427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982762
86	NC_016582	CG	3	6	4503	4508	0 %	0 %	50 %	50 %	374982762
87	NC_016582	TGC	2	6	4521	4526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
88	NC_016582	GCT	2	6	4552	4557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982762
89	NC_016582	GC	3	6	4588	4593	0 %	0 %	50 %	50 %	374982762
90	NC_016582	GAGTAC	2	12	4602	4613	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374982762
91	NC_016582	TCG	2	6	7231	7236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982763
92	NC_016582	GCCG	2	8	7266	7273	0 %	0 %	50 %	50 %	374982763
93	NC_016582	CGA	2	6	7274	7279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982763
94	NC_016582	ACG	2	6	7288	7293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982763
95	NC_016582	GCG	2	6	7315	7320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982763
96	NC_016582	CAG	2	6	7369	7374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982763
97	NC_016582	GTG	2	6	7453	7458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374982764
98	NC_016582	GC	3	6	7475	7480	0 %	0 %	50 %	50 %	374982764
99	NC_016582	CGG	2	6	7481	7486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982764
100	NC_016582	CGC	2	6	7496	7501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982764
101	NC_016582	GCG	3	9	7522	7530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982764
102	NC_016582	CG	3	6	7566	7571	0 %	0 %	50 %	50 %	374982764
103	NC_016582	CGG	2	6	7598	7603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982764
104	NC_016582	GCA	2	6	7622	7627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982764
105	NC_016582	GCG	2	6	7630	7635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982764
106	NC_016582	TGT	2	6	7658	7663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374982764
107	NC_016582	GGT	2	6	7674	7679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374982764
108	NC_016582	GGT	2	6	7704	7709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374982764
109	NC_016582	ACGG	2	8	7726	7733	25 %	0 %	50 %	25 %	374982764
110	NC_016582	GC	3	6	7741	7746	0 %	0 %	50 %	50 %	374982764
111	NC_016582	CGT	2	6	7754	7759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982764
112	NC_016582	GTGG	2	8	7767	7774	0 %	25 %	75 %	0 %	374982764
113	NC_016582	TGG	2	6	7780	7785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374982764
114	NC_016582	GCT	2	6	7790	7795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982764
115	NC_016582	TGC	2	6	7850	7855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982764
116	NC_016582	CGG	2	6	7859	7864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982764
117	NC_016582	TGA	2	6	7871	7876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374982764
118	NC_016582	GGA	2	6	7883	7888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374982764
119	NC_016582	TGT	2	6	7907	7912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374982764
120	NC_016582	GGC	2	6	8022	8027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982764
121	NC_016582	CGG	3	9	8069	8077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982765
122	NC_016582	ACG	2	6	8080	8085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982765
123	NC_016582	GGC	2	6	8106	8111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982765
124	NC_016582	GGC	2	6	8152	8157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982765
125	NC_016582	GCC	2	6	8159	8164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982765
126	NC_016582	CGG	2	6	8179	8184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982765
127	NC_016582	TGG	2	6	8196	8201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374982765
128	NC_016582	CTT	2	6	8227	8232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374982765
129	NC_016582	CA	3	6	8250	8255	50 %	0 %	0 %	50 %	374982765
130	NC_016582	CGG	2	6	8266	8271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982765
131	NC_016582	GGCGGT	2	12	8309	8320	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374982765
132	NC_016582	CTC	2	6	8321	8326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374982765
133	NC_016582	GGT	2	6	8350	8355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374982765
134	NC_016582	GAG	3	9	8366	8374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374982765
135	NC_016582	AG	3	6	8373	8378	50 %	0 %	50 %	0 %	374982765
136	NC_016582	GCGG	2	8	8387	8394	0 %	0 %	75 %	25 %	374982765
137	NC_016582	TGC	2	6	8528	8533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982766
138	NC_016582	CCG	2	6	8549	8554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982766
139	NC_016582	GCG	2	6	8567	8572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982766
140	NC_016582	CG	3	6	8571	8576	0 %	0 %	50 %	50 %	374982766
141	NC_016582	CGG	2	6	8598	8603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982766
142	NC_016582	GAC	2	6	8620	8625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982766
143	NC_016582	GGT	2	6	8649	8654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374982766
144	NC_016582	GCA	2	6	8664	8669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982766
145	NC_016582	C	10	10	8676	8685	0 %	0 %	0 %	100 %	374982767
146	NC_016582	CTG	2	6	8804	8809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982767
147	NC_016582	GCG	2	6	8820	8825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982767
148	NC_016582	CG	3	6	8830	8835	0 %	0 %	50 %	50 %	374982767
149	NC_016582	TCG	2	6	9081	9086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982768
150	NC_016582	CGT	2	6	9178	9183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982768
151	NC_016582	GAA	2	6	9239	9244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374982768
152	NC_016582	GTT	2	6	9248	9253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374982768
153	NC_016582	ACGGC	2	10	9390	9399	20 %	0 %	40 %	40 %	374982768
154	NC_016582	CACG	2	8	9419	9426	25 %	0 %	25 %	50 %	374982768
155	NC_016582	GCC	2	6	9449	9454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982768
156	NC_016582	CTC	2	6	9497	9502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374982768
157	NC_016582	CAG	2	6	9511	9516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982768
158	NC_016582	TCC	2	6	9800	9805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374982769
159	NC_016582	CCA	2	6	9834	9839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374982769
160	NC_016582	CGCC	2	8	9855	9862	0 %	0 %	25 %	75 %	374982769
161	NC_016582	GCG	2	6	12136	12141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982770
162	NC_016582	CTG	2	6	12153	12158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982770
163	NC_016582	GTC	2	6	12231	12236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982770
164	NC_016582	GCA	2	6	12271	12276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982770
165	NC_016582	GGC	2	6	12319	12324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982770
166	NC_016582	GAG	2	6	12330	12335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374982770
167	NC_016582	GTA	2	6	12399	12404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374982770
168	NC_016582	CTG	2	6	12438	12443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982770
169	NC_016582	CTG	2	6	12462	12467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982770
170	NC_016582	CCG	2	6	12717	12722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982771
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172	NC_016582	TGA	2	6	12765	12770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374982771
173	NC_016582	CTG	2	6	12863	12868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982771
174	NC_016582	GGA	2	6	12871	12876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374982771
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176	NC_016582	CGA	2	6	12940	12945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982771
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192	NC_016582	CCG	3	9	14131	14139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982772
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243	NC_016582	GGC	2	6	16053	16058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982776
244	NC_016582	GCG	2	6	16110	16115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982776
245	NC_016582	TCG	2	6	16120	16125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982776
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247	NC_016582	CCA	2	6	16202	16207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374982776
248	NC_016582	CGG	3	9	16235	16243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982776
249	NC_016582	GTCCTC	2	12	16248	16259	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374982776
250	NC_016582	GT	3	6	16291	16296	0 %	50 %	50 %	0 %	374982776
251	NC_016582	GC	3	6	16303	16308	0 %	0 %	50 %	50 %	374982776
252	NC_016582	GGGC	2	8	16361	16368	0 %	0 %	75 %	25 %	374982776
253	NC_016582	TGA	2	6	16388	16393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374982776
254	NC_016582	TCG	2	6	16408	16413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982776
255	NC_016582	GAG	2	6	16431	16436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374982776
256	NC_016582	GTG	2	6	16456	16461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374982776
257	NC_016582	GCC	2	6	16530	16535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982776
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259	NC_016582	CGT	2	6	16586	16591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982776
260	NC_016582	CCA	2	6	16641	16646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374982776
261	NC_016582	GTC	2	6	16673	16678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982776
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268	NC_016582	CGGG	2	8	16915	16922	0 %	0 %	75 %	25 %	374982776
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372	NC_016582	ACG	2	6	22437	22442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982782
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374	NC_016582	CAG	2	6	22508	22513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982782
375	NC_016582	GC	3	6	22552	22557	0 %	0 %	50 %	50 %	374982782
376	NC_016582	GCA	2	6	22581	22586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374982782
377	NC_016582	CTA	2	6	22724	22729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374982783
378	NC_016582	CGC	2	6	22814	22819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982783
379	NC_016582	CA	3	6	23122	23127	50 %	0 %	0 %	50 %	374982784
380	NC_016582	GTC	2	6	23159	23164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374982784
381	NC_016582	GCGCG	2	10	23176	23185	0 %	0 %	60 %	40 %	374982784
382	NC_016582	CGG	2	6	23244	23249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374982784
383	NC_016582	ATG	2	6	23348	23353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374982784
384	NC_016582	GTG	2	6	23386	23391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374982784
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386	NC_016582	CGC	2	6	23404	23409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374982784
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